随着医疗卫生事业的发展，为了满足全身性肿瘤患者的就医需求，贵阳市第二人民医院与中国医学科学院、中国协和医科大学肿瘤医院联合创办的贵阳肿瘤协作医院于2003年3月28日正式挂牌。中国医学科学院、中国协和医科大学肿瘤医院，是亚洲地区最大的肿瘤防治研究中心，是世界卫生组织癌症研究合作中心之一，也是全国肿瘤学术交流中心、卫生部全国肿瘤办公室，中国癌症研究基金会、中国抗癌协会临床肿瘤学协作中心。医院集医疗、教学、科研、预防为一体，主要开展对肿瘤预防、诊断、治疗的研究。院内学科设置众多，技术力量雄厚，仪器设备先进，是一所国家级肿瘤专科医院。医院开展手术、放疗、生物治疗、介入治疗等，对肿瘤的诊治水平国内领先，一些方面已经达到国际先进水平。医院誉满海内外，国际交流广泛，与美国、英国、日本、法国等国家建立了良好的合作关系。
　　中国医学科学院、中国协和医科大学肿瘤医院积极贯彻联合创办贵阳肿瘤协作医院，中国医学科学院、中国协和医科大学肿瘤医院的专家将长期在贵阳市第二人民医院工作，使贫穷地区的广大肿瘤患者能就近享受到北京专家精湛一流的技术服务。
　　贵阳肿瘤协作医院配置了国际先进的瑞典SLI直线加速器、体部X刀、Libeger头部X刀、模拟机、后装治疗机、Scondtronics三维水箱等先进的放疗设备，修建了环境优美、设备齐全的住院大楼，先后派出各级各类医务人员前往中国医学科学院、中国协和医科大学肿瘤医院、昆明陆军总医院学成回来。